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【论文题名】 玉米品种DNA指纹数据库构建的标准化规范
【英文题名】 Criteria for the Construction of Maize DNA Fingerprint Database
【 刊  名 】 分子植物育种
【英文刊名】 MOLECULAR PLANT BREEDING
【 分类号 】 S5
【 作  者 】 戴景瑞
【作者单位】
【 年卷期 】 2007年 5卷 01期 128-132页
【 关键词 】 玉米;DNA指纹;数据库
【基金名称】 北京市自然科学基金;北京农业育种基础研究创新平台项目;吉林省科技计划项目;北京市科技新星项目
【 摘  要 】 为了保证玉米品种DNA指纹库构建的标准化,从建库标记、检测平台、试剂、样品、评估程序、数据整合、模式库、扩展库、随机盲测等九个方面进行了全面的规范:(1)通过对不同分子标记的比较,确定SSR标记作为建库标记;(2)通过对不同DNA指纹检测方法的比较,确定毛细管电泳结合多色荧光检测方法作为DNA指纹片段分析方法;(3)规范了DNA、引物、Taq酶等试剂质量,以保证数据的稳定性和可重复性;(4)规范了样品来源、样品类型及分析样品数量;(5)确定评估品种的数量及引物的取舍标准;(6)为解决不同来源DNA指纹数据的有效整合问题,提出了固定一套核心引物、提供标准品种、提供标准DNA、确定引物等位基因BIN、规定对异常带型数据处理方式、规定数据的编码方式等6个解决策略;(7)规范了构建模式库的材料名单、来源及构建方式;(8)规范了构建扩展库的材料来源及构建方式;(9)进行数据库数据随机盲测,以评估入库数据质量.以上规范将为不同单位合作开展大规模的DNA指纹库构建研究奠定基础.
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